ISIS installation problems

Hello. I just tried installing ISIS following the directions given here, but when it was done the only thing in my ~/miniconda3/envs/isis directory was something called “conda-meta”. I also tried running some isis commands and it just said command not found. Here’s the transcript of what I did and the results:

(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda create -n isis
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done

==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.12.0
latest version: 4.13.0

Please update conda by running

$ conda update -n base -c defaults conda

Package Plan

environment location: /Users/stephen/miniconda3/envs/isis

Proceed ([y]/n)? y

Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done

To activate this environment, use

$ conda activate isis

To deactivate an active environment, use

$ conda deactivate

(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda config --env --add channels conda-forge
(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda config --env --add channels usgs-astrogeology
(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda config --show channels
channels:

  • usgs-astrogeology
  • conda-forge
  • defaults

(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda install -c usgs-astrogeology isis=7.0.0
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: done

==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.12.0
latest version: 4.13.0

Please update conda by running

$ conda update -n base -c defaults conda

Package Plan

environment location: /Users/stephen/miniconda3

added / updated specs:
- isis=7.0.0

The following packages will be downloaded:

package                    |            build
---------------------------|-----------------
ale-0.8.7                  |   py39hf018cea_1         205 KB  conda-forge
aom-3.3.0                  |       h96cf925_1         3.2 MB  conda-forge
armadillo-11.2.3           |       ha02a57f_0         656 KB  conda-forge
arpack-3.7.0               |       hefb7bc6_2         195 KB  conda-forge
blas-2.115                 |         openblas          13 KB  conda-forge
blas-devel-3.9.0           |15_osx64_openblas          12 KB  conda-forge
boost-1.72.0               |   py39hb64e6f8_1         346 KB  conda-forge
boost-cpp-1.72.0           |       hf3dc895_6        15.3 MB  conda-forge
bullet-2.86.1              |                0         1.6 MB  usgs-astrogeology
bz2file-0.98               |             py_0           9 KB  conda-forge
bzip2-1.0.8                |       h0d85af4_4         155 KB  conda-forge
c-ares-1.18.1              |       h0d85af4_0         100 KB  conda-forge
ca-certificates-2022.6.15  |       h033912b_0         149 KB  conda-forge
cairo-1.16.0               |    h9e0e54b_1010         1.4 MB  conda-forge
certifi-2022.6.15          |   py39h6e9494a_0         155 KB  conda-forge
conda-4.13.0               |   py39h6e9494a_1         986 KB  conda-forge
csm-3.0.3.3                |                0          89 KB  conda-forge
cspice-67                  |       hac89ed1_2        11.6 MB  conda-forge
curl-7.83.1                |       h23f1065_0         147 KB  conda-forge
cyrus-sasl-2.1.27          |       hbdf3212_5         217 KB  conda-forge
eigen-3.4.0                |       h940c156_0         1.2 MB  conda-forge
embree-2.16.0              |       h6834224_0        51.6 MB  usgs-astrogeology
expat-2.4.8                |       h96cf925_0         146 KB  conda-forge
ffmpeg-4.4.1               |       h2579ba5_2        10.5 MB  conda-forge
flann-1.9.1                |    h30321d8_1010         2.7 MB  conda-forge
font-ttf-dejavu-sans-mono-2.37|       hab24e00_0         388 KB  conda-forge
font-ttf-inconsolata-3.000 |       h77eed37_0          94 KB  conda-forge
font-ttf-source-code-pro-2.038|       h77eed37_0         684 KB  conda-forge
font-ttf-ubuntu-0.83       |       hab24e00_0         1.9 MB  conda-forge
fontconfig-2.14.0          |       h676cef8_0         281 KB  conda-forge
fonts-conda-ecosystem-1    |                0           4 KB  conda-forge
fonts-conda-forge-1        |                0           4 KB  conda-forge
freetype-2.10.4            |       h4cff582_1         890 KB  conda-forge
geos-3.7.3                 |       h4a8c4bd_0         744 KB  conda-forge
geotiff-1.7.1              |       ha1a2aeb_3         128 KB  conda-forge
gettext-0.19.8.1           |    hd1a6beb_1008         3.3 MB  conda-forge
gmm-5.0                    |       h6aef312_0         120 KB  usgs-astrogeology
gmp-6.2.1                  |       h2e338ed_0         774 KB  conda-forge
gnutls-3.6.13              |       h756fd2b_1         2.0 MB  conda-forge
graphite2-1.3.13           |    h2e338ed_1001          85 KB  conda-forge
gsl-2.7                    |       h93259b0_0         3.1 MB  conda-forge
harfbuzz-4.2.0             |       h48644e2_0         2.1 MB  conda-forge
hdf5-1.12.1                |nompi_h0aa1fa2_104         3.7 MB  conda-forge
icu-69.1                   |       he49afe7_0        12.9 MB  conda-forge
inja-3.3.0                 |       he49afe7_0          29 KB  conda-forge
isis-7.0.0                 |                0        13.0 MB  usgs-astrogeology
jama-125                   |                0          15 KB  usgs-astrogeology
jasper-2.0.33              |       h013e400_0         1.2 MB  conda-forge
jpeg-9e                    |       hac89ed1_2         260 KB  conda-forge
kakadu-1                   |                0         6.2 MB  usgs-astrogeology
krb5-1.19.3                |       hb98e516_0         1.3 MB  conda-forge
lame-3.100                 |    h35c211d_1001         521 KB  conda-forge
lerc-4.0.0                 |       hb486fe8_0         284 KB  conda-forge
libblas-3.9.0              |15_osx64_openblas          12 KB  conda-forge
libcblas-3.9.0             |15_osx64_openblas          12 KB  conda-forge
libclang-13.0.1            |default_he082bbe_0         8.0 MB  conda-forge
libcurl-7.83.1             |       h23f1065_0         318 KB  conda-forge
libcxx-14.0.6              |       hce7ea42_0         1.3 MB  conda-forge
libdeflate-1.12            |       hac89ed1_0          84 KB  conda-forge
libedit-3.1.20191231       |       h0678c8f_2         103 KB  conda-forge
libev-4.33                 |       haf1e3a3_1          99 KB  conda-forge
libevent-2.1.10            |       h7d65743_4         1.0 MB  conda-forge
libffi-3.4.2               |       h0d85af4_5          50 KB  conda-forge
libgfortran-5.0.0          |9_3_0_h6c81a4c_23          19 KB  conda-forge
libgfortran5-9.3.0         |      h6c81a4c_23         1.7 MB  conda-forge
libglib-2.72.1             |       hfbcb929_0         2.9 MB  conda-forge
libiconv-1.16              |       haf1e3a3_0         1.3 MB  conda-forge
liblapack-3.9.0            |15_osx64_openblas          12 KB  conda-forge
liblapacke-3.9.0           |15_osx64_openblas          12 KB  conda-forge
libllvm13-13.0.1           |       h64f94b2_2        25.3 MB  conda-forge
libnghttp2-1.47.0          |       hca56917_0         874 KB  conda-forge
libntlm-1.4                |    h35c211d_1002          31 KB  conda-forge
libopenblas-0.3.20         |openmp_h4e9756f_1         9.6 MB  conda-forge
libopencv-4.5.5            |   py39hc2bf5a6_7        30.9 MB  conda-forge
libpng-1.6.37              |       h5a3d3bf_3         312 KB  conda-forge
libpq-14.4                 |       h2b7167c_0         2.9 MB  conda-forge
libprotobuf-3.19.4         |       hcf210ce_0         2.2 MB  conda-forge
libssh2-1.10.0             |       hd3787cc_2         221 KB  conda-forge
libtiff-4.4.0              |       h4aaeabe_2         607 KB  conda-forge
libvpx-1.11.0              |       he49afe7_3         1.4 MB  conda-forge
libwebp-base-1.2.3         |       hac89ed1_2         391 KB  conda-forge
libxcb-1.13                |    h0d85af4_1004         305 KB  conda-forge
libxml2-2.9.12             |       h7e28ab6_1         684 KB  conda-forge
libzlib-1.2.12             |       hfe4f2af_1          63 KB  conda-forge
llvm-openmp-14.0.4         |       ha654fa7_0         329 KB  conda-forge
lz4-c-1.9.3                |       he49afe7_1         155 KB  conda-forge
macports-legacy-support-1.0.6|       h5eb16cf_0          31 KB  conda-forge
mesalib-21.2.5             |       h2df1e00_3         3.4 MB  conda-forge
metis-5.1.0                |    h2e338ed_1006         4.1 MB  conda-forge
mpfr-4.1.0                 |       h0f52abe_1         400 KB  conda-forge
mysql-8.0.28               |       h88f4db0_2         358 KB  conda-forge
mysql-client-8.0.28        |       h7ddd48c_2        32.9 MB  conda-forge
mysql-common-8.0.28        |       hdd8d184_2         1.8 MB  conda-forge
mysql-devel-8.0.28         |       hdd8d184_2         2.2 MB  conda-forge
mysql-libs-8.0.28          |       h353f102_2         1.9 MB  conda-forge
mysql-server-8.0.28        |       h6edde1b_2        23.8 MB  conda-forge
nanoflann-1.4.2            |       h694c41f_0          20 KB  conda-forge
nettle-3.6                 |       hedd7734_0         1.2 MB  conda-forge
networkx-2.8.5             |     pyhd8ed1ab_0         1.5 MB  conda-forge
nlohmann_json-3.10.5       |       hb486fe8_1         103 KB  conda-forge
nn-1.86.0                  |    h1de35cc_2003         146 KB  conda-forge
nspr-4.32                  |       hcd9eead_1         247 KB  conda-forge
nss-3.78                   |       ha8197d3_0         2.0 MB  conda-forge
numpy-1.23.1               |   py39hda39a74_0         6.6 MB  conda-forge
openblas-0.3.20            |openmp_h2608fb9_1        10.6 MB  conda-forge
opencv-4.5.5               |   py39h6e9494a_7          22 KB  conda-forge
openh264-2.1.1             |       hfd3ada9_0         1.5 MB  conda-forge
openssl-3.0.5              |       hfe4f2af_0         2.5 MB  conda-forge
pcl-1.11.1                 |       h7984e4d_1        16.4 MB  conda-forge
pcre-8.45                  |       he49afe7_0         220 KB  conda-forge
pixman-0.40.0              |       hbcb3906_0         615 KB  conda-forge
proj-9.0.1                 |       h05f0992_1         2.8 MB  conda-forge
protobuf-3.19.4            |   py39h9fcab8e_0         298 KB  conda-forge
pthread-stubs-0.4          |    hc929b4f_1001           6 KB  conda-forge
pvl-1.3.1                  |     pyhd8ed1ab_0          53 KB  conda-forge
py-opencv-4.5.5            |   py39h71a6800_7         1.1 MB  conda-forge
python-3.9.10              |hea1dfa3_2_cpython        12.5 MB  conda-forge
python-dateutil-2.8.2      |     pyhd8ed1ab_0         240 KB  conda-forge
python_abi-3.9             |           2_cp39           4 KB  conda-forge
pytz-2022.1                |     pyhd8ed1ab_0         242 KB  conda-forge
pyyaml-6.0                 |   py39h63b48b0_4         172 KB  conda-forge
qhull-2020.2               |       h940c156_2         1.8 MB  conda-forge
qt-5.12.9                  |       h2a607e2_5        87.9 MB  conda-forge
qwt-6.2.0                  |       h0f3c874_2         4.3 MB  conda-forge
scipy-1.9.0                |   py39h29d19b3_0        23.1 MB  conda-forge
spiceypy-5.1.1             |     pyhd8ed1ab_0         161 KB  conda-forge
sqlite-3.39.2              |       hd9f0692_0         1.8 MB  conda-forge
suitesparse-5.10.1         |       h7aff33d_1         2.5 MB  conda-forge
superlu-5.2.2              |       h1f0f902_0         330 KB  conda-forge
svt-av1-0.9.1              |       h96cf925_0         3.3 MB  conda-forge
tbb-2021.5.0               |       hbb4e6a2_1         157 KB  conda-forge
tnt-126                    |                0          18 KB  usgs-astrogeology
x264-1!161.3030            |       h0d85af4_1         2.5 MB  conda-forge
x265-3.5                   |       hbb4e6a2_3         3.3 MB  conda-forge
xerces-c-3.2.3             |       h6564042_4         1.5 MB  conda-forge
xorg-damageproto-1.2.1     |    h0d85af4_1002          25 KB  conda-forge
xorg-fixesproto-5.0        |    h0d85af4_1002           9 KB  conda-forge
xorg-glproto-1.4.17        |    h0d85af4_1002          21 KB  conda-forge
xorg-inputproto-2.3.2      |    h35c211d_1002          19 KB  conda-forge
xorg-kbproto-1.0.7         |    h35c211d_1002          27 KB  conda-forge
xorg-libice-1.0.10         |       h0d85af4_0          48 KB  conda-forge
xorg-libsm-1.2.3           |    h0d85af4_1000          22 KB  conda-forge
xorg-libx11-1.7.2          |       h0d85af4_0         886 KB  conda-forge
xorg-libxau-1.0.9          |       h35c211d_0          11 KB  conda-forge
xorg-libxdamage-1.1.5      |       h0d85af4_1          10 KB  conda-forge
xorg-libxdmcp-1.1.3        |       h35c211d_0          17 KB  conda-forge
xorg-libxext-1.3.4         |       h0d85af4_1          43 KB  conda-forge
xorg-libxfixes-5.0.3       |    h0d85af4_1004          15 KB  conda-forge
xorg-libxi-1.7.10          |       h0d85af4_0          39 KB  conda-forge
xorg-libxrandr-1.5.2       |       h0d85af4_1          25 KB  conda-forge
xorg-libxrender-0.9.10     |    h0d85af4_1003          24 KB  conda-forge
xorg-randrproto-1.5.0      |    h0d85af4_1001          32 KB  conda-forge
xorg-renderproto-0.11.1    |    h0d85af4_1002           9 KB  conda-forge
xorg-util-macros-1.19.3    |       h35c211d_0          51 KB  conda-forge
xorg-xextproto-7.3.0       |    h35c211d_1002          28 KB  conda-forge
xorg-xf86vidmodeproto-2.3.1|    h0d85af4_1002          23 KB  conda-forge
xorg-xproto-7.0.31         |    h35c211d_1007          73 KB  conda-forge
zstd-1.5.2                 |       ha9df2e0_2         466 KB  conda-forge
------------------------------------------------------------
                                       Total:       518.0 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

ale conda-forge/osx-64::ale-0.8.7-py39hf018cea_1
aom conda-forge/osx-64::aom-3.3.0-h96cf925_1
armadillo conda-forge/osx-64::armadillo-11.2.3-ha02a57f_0
arpack conda-forge/osx-64::arpack-3.7.0-hefb7bc6_2
blas conda-forge/osx-64::blas-2.115-openblas
blas-devel conda-forge/osx-64::blas-devel-3.9.0-15_osx64_openblas
boost conda-forge/osx-64::boost-1.72.0-py39hb64e6f8_1
boost-cpp conda-forge/osx-64::boost-cpp-1.72.0-hf3dc895_6
bullet usgs-astrogeology/osx-64::bullet-2.86.1-0
bz2file conda-forge/noarch::bz2file-0.98-py_0
bzip2 conda-forge/osx-64::bzip2-1.0.8-h0d85af4_4
c-ares conda-forge/osx-64::c-ares-1.18.1-h0d85af4_0
cairo conda-forge/osx-64::cairo-1.16.0-h9e0e54b_1010
csm conda-forge/osx-64::csm-3.0.3.3-0
cspice conda-forge/osx-64::cspice-67-hac89ed1_2
curl conda-forge/osx-64::curl-7.83.1-h23f1065_0
cyrus-sasl conda-forge/osx-64::cyrus-sasl-2.1.27-hbdf3212_5
eigen conda-forge/osx-64::eigen-3.4.0-h940c156_0
embree usgs-astrogeology/osx-64::embree-2.16.0-h6834224_0
expat conda-forge/osx-64::expat-2.4.8-h96cf925_0
ffmpeg conda-forge/osx-64::ffmpeg-4.4.1-h2579ba5_2
flann conda-forge/osx-64::flann-1.9.1-h30321d8_1010
font-ttf-dejavu-s~ conda-forge/noarch::font-ttf-dejavu-sans-mono-2.37-hab24e00_0
font-ttf-inconsol~ conda-forge/noarch::font-ttf-inconsolata-3.000-h77eed37_0
font-ttf-source-c~ conda-forge/noarch::font-ttf-source-code-pro-2.038-h77eed37_0
font-ttf-ubuntu conda-forge/noarch::font-ttf-ubuntu-0.83-hab24e00_0
fontconfig conda-forge/osx-64::fontconfig-2.14.0-h676cef8_0
fonts-conda-ecosy~ conda-forge/noarch::fonts-conda-ecosystem-1-0
fonts-conda-forge conda-forge/noarch::fonts-conda-forge-1-0
freetype conda-forge/osx-64::freetype-2.10.4-h4cff582_1
geos conda-forge/osx-64::geos-3.7.3-h4a8c4bd_0
geotiff conda-forge/osx-64::geotiff-1.7.1-ha1a2aeb_3
gettext conda-forge/osx-64::gettext-0.19.8.1-hd1a6beb_1008
gmm usgs-astrogeology/osx-64::gmm-5.0-h6aef312_0
gmp conda-forge/osx-64::gmp-6.2.1-h2e338ed_0
gnutls conda-forge/osx-64::gnutls-3.6.13-h756fd2b_1
graphite2 conda-forge/osx-64::graphite2-1.3.13-h2e338ed_1001
gsl conda-forge/osx-64::gsl-2.7-h93259b0_0
harfbuzz conda-forge/osx-64::harfbuzz-4.2.0-h48644e2_0
hdf5 conda-forge/osx-64::hdf5-1.12.1-nompi_h0aa1fa2_104
icu conda-forge/osx-64::icu-69.1-he49afe7_0
inja conda-forge/osx-64::inja-3.3.0-he49afe7_0
isis usgs-astrogeology/osx-64::isis-7.0.0-0
jama usgs-astrogeology/osx-64::jama-125-0
jasper conda-forge/osx-64::jasper-2.0.33-h013e400_0
jpeg conda-forge/osx-64::jpeg-9e-hac89ed1_2
kakadu usgs-astrogeology/osx-64::kakadu-1-0
krb5 conda-forge/osx-64::krb5-1.19.3-hb98e516_0
lame conda-forge/osx-64::lame-3.100-h35c211d_1001
lerc conda-forge/osx-64::lerc-4.0.0-hb486fe8_0
libblas conda-forge/osx-64::libblas-3.9.0-15_osx64_openblas
libcblas conda-forge/osx-64::libcblas-3.9.0-15_osx64_openblas
libclang conda-forge/osx-64::libclang-13.0.1-default_he082bbe_0
libcurl conda-forge/osx-64::libcurl-7.83.1-h23f1065_0
libdeflate conda-forge/osx-64::libdeflate-1.12-hac89ed1_0
libedit conda-forge/osx-64::libedit-3.1.20191231-h0678c8f_2
libev conda-forge/osx-64::libev-4.33-haf1e3a3_1
libevent conda-forge/osx-64::libevent-2.1.10-h7d65743_4
libgfortran conda-forge/osx-64::libgfortran-5.0.0-9_3_0_h6c81a4c_23
libgfortran5 conda-forge/osx-64::libgfortran5-9.3.0-h6c81a4c_23
libglib conda-forge/osx-64::libglib-2.72.1-hfbcb929_0
libiconv conda-forge/osx-64::libiconv-1.16-haf1e3a3_0
liblapack conda-forge/osx-64::liblapack-3.9.0-15_osx64_openblas
liblapacke conda-forge/osx-64::liblapacke-3.9.0-15_osx64_openblas
libllvm13 conda-forge/osx-64::libllvm13-13.0.1-h64f94b2_2
libnghttp2 conda-forge/osx-64::libnghttp2-1.47.0-hca56917_0
libntlm conda-forge/osx-64::libntlm-1.4-h35c211d_1002
libopenblas conda-forge/osx-64::libopenblas-0.3.20-openmp_h4e9756f_1
libopencv conda-forge/osx-64::libopencv-4.5.5-py39hc2bf5a6_7
libpng conda-forge/osx-64::libpng-1.6.37-h5a3d3bf_3
libpq conda-forge/osx-64::libpq-14.4-h2b7167c_0
libprotobuf conda-forge/osx-64::libprotobuf-3.19.4-hcf210ce_0
libssh2 conda-forge/osx-64::libssh2-1.10.0-hd3787cc_2
libtiff conda-forge/osx-64::libtiff-4.4.0-h4aaeabe_2
libvpx conda-forge/osx-64::libvpx-1.11.0-he49afe7_3
libwebp-base conda-forge/osx-64::libwebp-base-1.2.3-hac89ed1_2
libxcb conda-forge/osx-64::libxcb-1.13-h0d85af4_1004
libxml2 conda-forge/osx-64::libxml2-2.9.12-h7e28ab6_1
libzlib conda-forge/osx-64::libzlib-1.2.12-hfe4f2af_1
llvm-openmp conda-forge/osx-64::llvm-openmp-14.0.4-ha654fa7_0
lz4-c conda-forge/osx-64::lz4-c-1.9.3-he49afe7_1
macports-legacy-s~ conda-forge/osx-64::macports-legacy-support-1.0.6-h5eb16cf_0
mesalib conda-forge/osx-64::mesalib-21.2.5-h2df1e00_3
metis conda-forge/osx-64::metis-5.1.0-h2e338ed_1006
mpfr conda-forge/osx-64::mpfr-4.1.0-h0f52abe_1
mysql conda-forge/osx-64::mysql-8.0.28-h88f4db0_2
mysql-client conda-forge/osx-64::mysql-client-8.0.28-h7ddd48c_2
mysql-common conda-forge/osx-64::mysql-common-8.0.28-hdd8d184_2
mysql-devel conda-forge/osx-64::mysql-devel-8.0.28-hdd8d184_2
mysql-libs conda-forge/osx-64::mysql-libs-8.0.28-h353f102_2
mysql-server conda-forge/osx-64::mysql-server-8.0.28-h6edde1b_2
nanoflann conda-forge/osx-64::nanoflann-1.4.2-h694c41f_0
nettle conda-forge/osx-64::nettle-3.6-hedd7734_0
networkx conda-forge/noarch::networkx-2.8.5-pyhd8ed1ab_0
nlohmann_json conda-forge/osx-64::nlohmann_json-3.10.5-hb486fe8_1
nn conda-forge/osx-64::nn-1.86.0-h1de35cc_2003
nspr conda-forge/osx-64::nspr-4.32-hcd9eead_1
nss conda-forge/osx-64::nss-3.78-ha8197d3_0
numpy conda-forge/osx-64::numpy-1.23.1-py39hda39a74_0
openblas conda-forge/osx-64::openblas-0.3.20-openmp_h2608fb9_1
opencv conda-forge/osx-64::opencv-4.5.5-py39h6e9494a_7
openh264 conda-forge/osx-64::openh264-2.1.1-hfd3ada9_0
pcl conda-forge/osx-64::pcl-1.11.1-h7984e4d_1
pcre conda-forge/osx-64::pcre-8.45-he49afe7_0
pixman conda-forge/osx-64::pixman-0.40.0-hbcb3906_0
proj conda-forge/osx-64::proj-9.0.1-h05f0992_1
protobuf conda-forge/osx-64::protobuf-3.19.4-py39h9fcab8e_0
pthread-stubs conda-forge/osx-64::pthread-stubs-0.4-hc929b4f_1001
pvl conda-forge/noarch::pvl-1.3.1-pyhd8ed1ab_0
py-opencv conda-forge/osx-64::py-opencv-4.5.5-py39h71a6800_7
python-dateutil conda-forge/noarch::python-dateutil-2.8.2-pyhd8ed1ab_0
python_abi conda-forge/osx-64::python_abi-3.9-2_cp39
pytz conda-forge/noarch::pytz-2022.1-pyhd8ed1ab_0
pyyaml conda-forge/osx-64::pyyaml-6.0-py39h63b48b0_4
qhull conda-forge/osx-64::qhull-2020.2-h940c156_2
qt conda-forge/osx-64::qt-5.12.9-h2a607e2_5
qwt conda-forge/osx-64::qwt-6.2.0-h0f3c874_2
scipy conda-forge/osx-64::scipy-1.9.0-py39h29d19b3_0
spiceypy conda-forge/noarch::spiceypy-5.1.1-pyhd8ed1ab_0
suitesparse conda-forge/osx-64::suitesparse-5.10.1-h7aff33d_1
superlu conda-forge/osx-64::superlu-5.2.2-h1f0f902_0
svt-av1 conda-forge/osx-64::svt-av1-0.9.1-h96cf925_0
tbb conda-forge/osx-64::tbb-2021.5.0-hbb4e6a2_1
tnt usgs-astrogeology/osx-64::tnt-126-0
x264 conda-forge/osx-64::x264-1!161.3030-h0d85af4_1
x265 conda-forge/osx-64::x265-3.5-hbb4e6a2_3
xerces-c conda-forge/osx-64::xerces-c-3.2.3-h6564042_4
xorg-damageproto conda-forge/osx-64::xorg-damageproto-1.2.1-h0d85af4_1002
xorg-fixesproto conda-forge/osx-64::xorg-fixesproto-5.0-h0d85af4_1002
xorg-glproto conda-forge/osx-64::xorg-glproto-1.4.17-h0d85af4_1002
xorg-inputproto conda-forge/osx-64::xorg-inputproto-2.3.2-h35c211d_1002
xorg-kbproto conda-forge/osx-64::xorg-kbproto-1.0.7-h35c211d_1002
xorg-libice conda-forge/osx-64::xorg-libice-1.0.10-h0d85af4_0
xorg-libsm conda-forge/osx-64::xorg-libsm-1.2.3-h0d85af4_1000
xorg-libx11 conda-forge/osx-64::xorg-libx11-1.7.2-h0d85af4_0
xorg-libxau conda-forge/osx-64::xorg-libxau-1.0.9-h35c211d_0
xorg-libxdamage conda-forge/osx-64::xorg-libxdamage-1.1.5-h0d85af4_1
xorg-libxdmcp conda-forge/osx-64::xorg-libxdmcp-1.1.3-h35c211d_0
xorg-libxext conda-forge/osx-64::xorg-libxext-1.3.4-h0d85af4_1
xorg-libxfixes conda-forge/osx-64::xorg-libxfixes-5.0.3-h0d85af4_1004
xorg-libxi conda-forge/osx-64::xorg-libxi-1.7.10-h0d85af4_0
xorg-libxrandr conda-forge/osx-64::xorg-libxrandr-1.5.2-h0d85af4_1
xorg-libxrender conda-forge/osx-64::xorg-libxrender-0.9.10-h0d85af4_1003
xorg-randrproto conda-forge/osx-64::xorg-randrproto-1.5.0-h0d85af4_1001
xorg-renderproto conda-forge/osx-64::xorg-renderproto-0.11.1-h0d85af4_1002
xorg-util-macros conda-forge/osx-64::xorg-util-macros-1.19.3-h35c211d_0
xorg-xextproto conda-forge/osx-64::xorg-xextproto-7.3.0-h35c211d_1002
xorg-xf86vidmodep~ conda-forge/osx-64::xorg-xf86vidmodeproto-2.3.1-h0d85af4_1002
xorg-xproto conda-forge/osx-64::xorg-xproto-7.0.31-h35c211d_1007
zstd conda-forge/osx-64::zstd-1.5.2-ha9df2e0_2

The following packages will be UPDATED:

ca-certificates pkgs/main::ca-certificates-2022.3.29-~ → conda-forge::ca-certificates-2022.6.15-h033912b_0
certifi pkgs/main::certifi-2021.10.8-py39hecd~ → conda-forge::certifi-2022.6.15-py39h6e9494a_0
conda pkgs/main::conda-4.12.0-py39hecd8cb5_0 → conda-forge::conda-4.13.0-py39h6e9494a_1
libcxx pkgs/main::libcxx-12.0.0-h2f01273_0 → conda-forge::libcxx-14.0.6-hce7ea42_0
libffi pkgs/main::libffi-3.3-hb1e8313_2 → conda-forge::libffi-3.4.2-h0d85af4_5
openssl pkgs/main::openssl-1.1.1n-hca72f7f_0 → conda-forge::openssl-3.0.5-hfe4f2af_0
sqlite pkgs/main::sqlite-3.38.2-h707629a_0 → conda-forge::sqlite-3.39.2-hd9f0692_0

The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:

python pkgs/main::python-3.9.12-hdfd78df_0 → conda-forge::python-3.9.10-hea1dfa3_2_cpython

Proceed ([y]/n)? y

Downloading and Extracting Packages
flann-1.9.1 | 2.7 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-kbproto-1.0.7 | 27 KB | ############################################################################### | 100%
geotiff-1.7.1 | 128 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxfixes-5.0.3 | 15 KB | ############################################################################### | 100%
libgfortran-5.0.0 | 19 KB | ############################################################################### | 100%
pcre-8.45 | 220 KB | ############################################################################### | 100%
mysql-libs-8.0.28 | 1.9 MB | ############################################################################### | 100%
cspice-67 | 11.6 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxau-1.0.9 | 11 KB | ############################################################################### | 100%
tbb-2021.5.0 | 157 KB | ############################################################################### | 100%
libzlib-1.2.12 | 63 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-fixesproto-5.0 | 9 KB | ############################################################################### | 100%
ale-0.8.7 | 205 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-randrproto-1.5. | 32 KB | ############################################################################### | 100%
mysql-common-8.0.28 | 1.8 MB | ############################################################################### | 100%
sqlite-3.39.2 | 1.8 MB | ############################################################################### | 100%
libpq-14.4 | 2.9 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-xf86vidmodeprot | 23 KB | ############################################################################### | 100%
lerc-4.0.0 | 284 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-glproto-1.4.17 | 21 KB | ############################################################################### | 100%
blas-2.115 | 13 KB | ############################################################################### | 100%
gnutls-3.6.13 | 2.0 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-xextproto-7.3.0 | 28 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-inputproto-2.3. | 19 KB | ############################################################################### | 100%
arpack-3.7.0 | 195 KB | ############################################################################### | 100%
libcurl-7.83.1 | 318 KB | ############################################################################### | 100%
x264-1!161.3030 | 2.5 MB | ############################################################################### | 100%
c-ares-1.18.1 | 100 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxrandr-1.5.2 | 25 KB | ############################################################################### | 100%
libblas-3.9.0 | 12 KB | ############################################################################### | 100%
freetype-2.10.4 | 890 KB | ############################################################################### | 100%
kakadu-1 | 6.2 MB | ############################################################################### | 100%
libpng-1.6.37 | 312 KB | ############################################################################### | 100%
libllvm13-13.0.1 | 25.3 MB | ############################################################################### | 100%
font-ttf-inconsolata | 94 KB | ############################################################################### | 100%
fontconfig-2.14.0 | 281 KB | ############################################################################### | 100%
py-opencv-4.5.5 | 1.1 MB | ############################################################################### | 100%
opencv-4.5.5 | 22 KB | ############################################################################### | 100%
llvm-openmp-14.0.4 | 329 KB | ############################################################################### | 100%
nspr-4.32 | 247 KB | ############################################################################### | 100%
eigen-3.4.0 | 1.2 MB | ############################################################################### | 100%
gsl-2.7 | 3.1 MB | ############################################################################### | 100%
font-ttf-ubuntu-0.83 | 1.9 MB | ############################################################################### | 100%
libffi-3.4.2 | 50 KB | ############################################################################### | 100%
metis-5.1.0 | 4.1 MB | ############################################################################### | 100%
libopenblas-0.3.20 | 9.6 MB | ############################################################################### | 100%
bzip2-1.0.8 | 155 KB | ############################################################################### | 100%
suitesparse-5.10.1 | 2.5 MB | ############################################################################### | 100%
x265-3.5 | 3.3 MB | ############################################################################### | 100%
protobuf-3.19.4 | 298 KB | ############################################################################### | 100%
libedit-3.1.20191231 | 103 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-damageproto-1.2 | 25 KB | ############################################################################### | 100%
certifi-2022.6.15 | 155 KB | ############################################################################### | 100%
libxcb-1.13 | 305 KB | ############################################################################### | 100%
lz4-c-1.9.3 | 155 KB | ############################################################################### | 100%
cairo-1.16.0 | 1.4 MB | ############################################################################### | 100%
libnghttp2-1.47.0 | 874 KB | ############################################################################### | 100%
libntlm-1.4 | 31 KB | ############################################################################### | 100%
svt-av1-0.9.1 | 3.3 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxext-1.3.4 | 43 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxi-1.7.10 | 39 KB | ############################################################################### | 100%
geos-3.7.3 | 744 KB | ############################################################################### | 100%
jasper-2.0.33 | 1.2 MB | ############################################################################### | 100%
mesalib-21.2.5 | 3.4 MB | ############################################################################### | 100%
embree-2.16.0 | 51.6 MB | ############################################################################### | 100%
nn-1.86.0 | 146 KB | ############################################################################### | 100%
libvpx-1.11.0 | 1.4 MB | ############################################################################### | 100%
boost-cpp-1.72.0 | 15.3 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-renderproto-0.1 | 9 KB | ############################################################################### | 100%
libprotobuf-3.19.4 | 2.2 MB | ############################################################################### | 100%
ca-certificates-2022 | 149 KB | ############################################################################### | 100%
libiconv-1.16 | 1.3 MB | ############################################################################### | 100%
pyyaml-6.0 | 172 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libx11-1.7.2 | 886 KB | ############################################################################### | 100%
python-dateutil-2.8. | 240 KB | ############################################################################### | 100%
gettext-0.19.8.1 | 3.3 MB | ############################################################################### | 100%
graphite2-1.3.13 | 85 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-util-macros-1.1 | 51 KB | ############################################################################### | 100%
lame-3.100 | 521 KB | ############################################################################### | 100%
ffmpeg-4.4.1 | 10.5 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxrender-0.9. | 24 KB | ############################################################################### | 100%
mysql-server-8.0.28 | 23.8 MB | ############################################################################### | 100%
libtiff-4.4.0 | 607 KB | ############################################################################### | 100%
jama-125 | 15 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxdmcp-1.1.3 | 17 KB | ############################################################################### | 100%
liblapack-3.9.0 | 12 KB | ############################################################################### | 100%
numpy-1.23.1 | 6.6 MB | ############################################################################### | 100%
openblas-0.3.20 | 10.6 MB | ############################################################################### | 100%
aom-3.3.0 | 3.2 MB | ############################################################################### | 100%
bullet-2.86.1 | 1.6 MB | ############################################################################### | 100%
nanoflann-1.4.2 | 20 KB | ############################################################################### | 100%
cyrus-sasl-2.1.27 | 217 KB | ############################################################################### | 100%
qhull-2020.2 | 1.8 MB | ############################################################################### | 100%
libcblas-3.9.0 | 12 KB | ############################################################################### | 100%
fonts-conda-ecosyste | 4 KB | ############################################################################### | 100%
blas-devel-3.9.0 | 12 KB | ############################################################################### | 100%
gmp-6.2.1 | 774 KB | ############################################################################### | 100%
font-ttf-dejavu-sans | 388 KB | ############################################################################### | 100%
hdf5-1.12.1 | 3.7 MB | ############################################################################### | 100%
python_abi-3.9 | 4 KB | ############################################################################### | 100%
pthread-stubs-0.4 | 6 KB | ############################################################################### | 100%
openh264-2.1.1 | 1.5 MB | ############################################################################### | 100%
zstd-1.5.2 | 466 KB | ############################################################################### | 100%
libopencv-4.5.5 | 30.9 MB | ############################################################################### | 100%
harfbuzz-4.2.0 | 2.1 MB | ############################################################################### | 100%
libxml2-2.9.12 | 684 KB | ############################################################################### | 100%
liblapacke-3.9.0 | 12 KB | ############################################################################### | 100%
pcl-1.11.1 | 16.4 MB | ############################################################################### | 100%
xorg-libice-1.0.10 | 48 KB | ############################################################################### | 100%
expat-2.4.8 | 146 KB | ############################################################################### | 100%
mysql-client-8.0.28 | 32.9 MB | ############################################################################### | 100%
pixman-0.40.0 | 615 KB | ############################################################################### | 100%
pytz-2022.1 | 242 KB | ############################################################################### | 100%
tnt-126 | 18 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libxdamage-1.1. | 10 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-libsm-1.2.3 | 22 KB | ############################################################################### | 100%
spiceypy-5.1.1 | 161 KB | ############################################################################### | 100%
nettle-3.6 | 1.2 MB | ############################################################################### | 100%
inja-3.3.0 | 29 KB | ############################################################################### | 100%
libwebp-base-1.2.3 | 391 KB | ############################################################################### | 100%
gmm-5.0 | 120 KB | ############################################################################### | 100%
xerces-c-3.2.3 | 1.5 MB | ############################################################################### | 100%
scipy-1.9.0 | 23.1 MB | ############################################################################### | 100%
krb5-1.19.3 | 1.3 MB | ############################################################################### | 100%
nss-3.78 | 2.0 MB | ############################################################################### | 100%
libssh2-1.10.0 | 221 KB | ############################################################################### | 100%
isis-7.0.0 | 13.0 MB | ############################################################################### | 100%
python-3.9.10 | 12.5 MB | ############################################################################### | 100%
mpfr-4.1.0 | 400 KB | ############################################################################### | 100%
bz2file-0.98 | 9 KB | ############################################################################### | 100%
libgfortran5-9.3.0 | 1.7 MB | ############################################################################### | 100%
proj-9.0.1 | 2.8 MB | ############################################################################### | 100%
jpeg-9e | 260 KB | ############################################################################### | 100%
qwt-6.2.0 | 4.3 MB | ############################################################################### | 100%
nlohmann_json-3.10.5 | 103 KB | ############################################################################### | 100%
font-ttf-source-code | 684 KB | ############################################################################### | 100%
icu-69.1 | 12.9 MB | ############################################################################### | 100%
openssl-3.0.5 | 2.5 MB | ############################################################################### | 100%
csm-3.0.3.3 | 89 KB | ############################################################################### | 100%
libev-4.33 | 99 KB | ############################################################################### | 100%
xorg-xproto-7.0.31 | 73 KB | ############################################################################### | 100%
mysql-devel-8.0.28 | 2.2 MB | ############################################################################### | 100%
pvl-1.3.1 | 53 KB | ############################################################################### | 100%
boost-1.72.0 | 346 KB | ############################################################################### | 100%
fonts-conda-forge-1 | 4 KB | ############################################################################### | 100%
qt-5.12.9 | 87.9 MB | ############################################################################### | 100%
libclang-13.0.1 | 8.0 MB | ############################################################################### | 100%
conda-4.13.0 | 986 KB | ############################################################################### | 100%
armadillo-11.2.3 | 656 KB | ############################################################################### | 100%
libcxx-14.0.6 | 1.3 MB | ############################################################################### | 100%
mysql-8.0.28 | 358 KB | ############################################################################### | 100%
libdeflate-1.12 | 84 KB | ############################################################################### | 100%
libevent-2.1.10 | 1.0 MB | ############################################################################### | 100%
curl-7.83.1 | 147 KB | ############################################################################### | 100%
superlu-5.2.2 | 330 KB | ############################################################################### | 100%
networkx-2.8.5 | 1.5 MB | ############################################################################### | 100%
macports-legacy-supp | 31 KB | ############################################################################### | 100%
libglib-2.72.1 | 2.9 MB | ############################################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done

(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda --version
conda 4.13.0

(base) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda activate isis

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ cd miniconda3/

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:miniconda3 stephen$ ls
AUTHORS.rst appdata envs libexec phrasebooks resources ssl
CHANGELOG.md bin etc make pkgs sbin translations
IsisPreferences conda-meta fonts man plugins scripts var
LICENSE.md condabin include mkspecs python.app share version
LICENSE.txt doc lib mysql qml shell

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:miniconda3 stephen$ ls
AUTHORS.rst appdata envs libexec phrasebooks resources ssl
CHANGELOG.md bin etc make pkgs sbin translations
IsisPreferences conda-meta fonts man plugins scripts var
LICENSE.md condabin include mkspecs python.app share version
LICENSE.txt doc lib mysql qml shell

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:miniconda3 stephen$ cd envs

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:envs stephen$ ls
isis

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:envs stephen$ cd isis

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:isis stephen$ ls
conda-meta

It looks like you installed ISIS into your root environment

Package Plan

environment location: /Users/stephen/miniconda3

added / updated specs:

  • isis=7.0.0

You should be able to just do conda activate to re-active your root environment and it will be ready to use.

OK, I don’t know what you mean by “you installed ISIS into your root environment”. How do you control what environment ISIS installs into? Which part of the installation directions covers that?

I had already deleted ISIS to try a different method using mamba that a colleague recommended, but that didn’t work either, so I decided to try the official installation method again (after using “conda clean --all”), and this time it seemed to install ISIS ok (the ~/miniconda3/envs/isis directory has lots of stuff in it now), but I still get an error message when I test it by trying to run “qview”.

The error message is:
dyld: Library not loaded: /opt/X11/lib/libGL.1.dylib
Referenced from: /Users/stephen/miniconda3/envs/isis/bin/qview
Reason: image not found
Abort trap: 6

Another colleague said she got a similar message when she installed ISIS but said she was able to fix it by running “conda update gsl”, so I tried that but still get the same error message. I also get the same error message when I tried to run another isis program (spiceinit). How can I fix this?

Anaconda allows you to have multiple environments which are nested under the envs directory in your installation. There is also a top level (sometimes called root or base) environment which is located right in the anaconda install directory. If you do not create and activate an environment when installing something, it will install directly into the top level environment. It looks like you missed the step the first time you installed ISIS and didn’t create/activate an environment. The good news is from your new information it looks like you did create an environment and installed into it.

I need a little more information about your setup to help with the library error. What version of MacOS are you running? Can you provide the environment list for the install so we can see what exactly got installed? Run conda list and paste the results, it should look something like this:

(usgscsm_dev) IGSWZAWGLT00014:build jmapel$ conda list
# packages in environment at envs/usgscsm_dev:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
ale                       0.8.7           py310h2fea185_1    conda-forge
bzip2                     1.0.8                h0d85af4_4    conda-forge
c-ares                    1.18.1               h0d85af4_0    conda-forge
ca-certificates           2022.6.15            h033912b_0    conda-forge
cmake                     3.23.3               hf2c7296_0    conda-forge
csm                       3.0.3.3                       0    conda-forge
cspice                    67                   hac89ed1_2    conda-forge
...

I’m running MacOS Catalina 10.15.7 on a MacBook Pro (2015). Here’s my conda list results:

(isis) Stephens-MacBook-Pro-10:~ stephen$ conda list
# packages in environment at /Users/stephen/miniconda3/envs/isis:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
ale                       0.8.7            py39hf018cea_1    conda-forge
aom                       3.3.0                h96cf925_1    conda-forge
armadillo                 11.2.3               ha02a57f_0    conda-forge
arpack                    3.7.0                hefb7bc6_2    conda-forge
blas                      2.115                  openblas    conda-forge
blas-devel                3.9.0           15_osx64_openblas    conda-forge
boost                     1.72.0           py39hb64e6f8_1    conda-forge
boost-cpp                 1.72.0               hf3dc895_6    conda-forge
bullet                    2.86.1                        0    usgs-astrogeology
bz2file                   0.98                       py_0    conda-forge
bzip2                     1.0.8                h0d85af4_4    conda-forge
c-ares                    1.18.1               h0d85af4_0    conda-forge
ca-certificates           2022.6.15            h033912b_0    conda-forge
cairo                     1.16.0            h9e0e54b_1010    conda-forge
csm                       3.0.3.3                       0    conda-forge
cspice                    67                   hac89ed1_2    conda-forge
curl                      7.83.1               h23f1065_0    conda-forge
cyrus-sasl                2.1.27               hbdf3212_5    conda-forge
eigen                     3.4.0                h940c156_0    conda-forge
embree                    2.16.0               h6834224_0    usgs-astrogeology
expat                     2.4.8                h96cf925_0    conda-forge
ffmpeg                    4.4.1                h2579ba5_2    conda-forge
flann                     1.9.1             h30321d8_1010    conda-forge
font-ttf-dejavu-sans-mono 2.37                 hab24e00_0    conda-forge
font-ttf-inconsolata      3.000                h77eed37_0    conda-forge
font-ttf-source-code-pro  2.038                h77eed37_0    conda-forge
font-ttf-ubuntu           0.83                 hab24e00_0    conda-forge
fontconfig                2.14.0               h676cef8_0    conda-forge
fonts-conda-ecosystem     1                             0    conda-forge
fonts-conda-forge         1                             0    conda-forge
freetype                  2.10.4               h4cff582_1    conda-forge
geos                      3.7.3                h4a8c4bd_0    conda-forge
geotiff                   1.7.1                ha1a2aeb_3    conda-forge
gettext                   0.19.8.1          hd1a6beb_1008    conda-forge
gmm                       5.0                  h6aef312_0    usgs-astrogeology
gmp                       6.2.1                h2e338ed_0    conda-forge
gnutls                    3.6.13               h756fd2b_1    conda-forge
graphite2                 1.3.13            h2e338ed_1001    conda-forge
gsl                       2.7                  h93259b0_0    conda-forge
harfbuzz                  4.2.0                h48644e2_0    conda-forge
hdf5                      1.12.1          nompi_h0aa1fa2_104    conda-forge
icu                       69.1                 he49afe7_0    conda-forge
inja                      3.3.0                he49afe7_0    conda-forge
isis                      7.0.0                         0    usgs-astrogeology
jama                      125                           0    usgs-astrogeology
jasper                    2.0.33               h013e400_0    conda-forge
jpeg                      9e                   hac89ed1_2    conda-forge
kakadu                    1                             0    usgs-astrogeology
krb5                      1.19.3               hb98e516_0    conda-forge
lame                      3.100             h35c211d_1001    conda-forge
lerc                      4.0.0                hb486fe8_0    conda-forge
libblas                   3.9.0           15_osx64_openblas    conda-forge
libcblas                  3.9.0           15_osx64_openblas    conda-forge
libclang                  13.0.1          default_he082bbe_0    conda-forge
libcurl                   7.83.1               h23f1065_0    conda-forge
libcxx                    14.0.6               hce7ea42_0    conda-forge
libdeflate                1.12                 hac89ed1_0    conda-forge
libedit                   3.1.20191231         h0678c8f_2    conda-forge
libev                     4.33                 haf1e3a3_1    conda-forge
libevent                  2.1.10               h7d65743_4    conda-forge
libffi                    3.4.2                h0d85af4_5    conda-forge
libgfortran               5.0.0           9_3_0_h6c81a4c_23    conda-forge
libgfortran5              9.3.0               h6c81a4c_23    conda-forge
libglib                   2.72.1               hfbcb929_0    conda-forge
libiconv                  1.16                 haf1e3a3_0    conda-forge
liblapack                 3.9.0           15_osx64_openblas    conda-forge
liblapacke                3.9.0           15_osx64_openblas    conda-forge
libllvm13                 13.0.1               h64f94b2_2    conda-forge
libnghttp2                1.47.0               hca56917_0    conda-forge
libntlm                   1.4               h35c211d_1002    conda-forge
libopenblas               0.3.20          openmp_h4e9756f_1    conda-forge
libopencv                 4.5.5            py39hc2bf5a6_7    conda-forge
libpng                    1.6.37               h5a3d3bf_3    conda-forge
libpq                     14.4                 h2b7167c_0    conda-forge
libprotobuf               3.19.4               hcf210ce_0    conda-forge
libssh2                   1.10.0               hd3787cc_2    conda-forge
libtiff                   4.4.0                h4aaeabe_2    conda-forge
libvpx                    1.11.0               he49afe7_3    conda-forge
libwebp-base              1.2.3                hac89ed1_2    conda-forge
libxcb                    1.13              h0d85af4_1004    conda-forge
libxml2                   2.9.12               h7e28ab6_1    conda-forge
libzlib                   1.2.12               hfe4f2af_2    conda-forge
llvm-openmp               14.0.4               ha654fa7_0    conda-forge
lz4-c                     1.9.3                he49afe7_1    conda-forge
macports-legacy-support   1.0.6                h5eb16cf_0    conda-forge
mesalib                   21.2.5               h2df1e00_3    conda-forge
metis                     5.1.0             h2e338ed_1006    conda-forge
mpfr                      4.1.0                h0f52abe_1    conda-forge
mysql                     8.0.28               h88f4db0_2    conda-forge
mysql-client              8.0.28               h7ddd48c_2    conda-forge
mysql-common              8.0.28               hdd8d184_2    conda-forge
mysql-devel               8.0.28               hdd8d184_2    conda-forge
mysql-libs                8.0.28               h353f102_2    conda-forge
mysql-server              8.0.28               h6edde1b_2    conda-forge
nanoflann                 1.4.2                h694c41f_0    conda-forge
ncurses                   6.3                  h96cf925_1    conda-forge
nettle                    3.6                  hedd7734_0    conda-forge
networkx                  2.8.5              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
nlohmann_json             3.10.5               hb486fe8_1    conda-forge
nn                        1.86.0            h1de35cc_2003    conda-forge
nspr                      4.32                 hcd9eead_1    conda-forge
nss                       3.78                 ha8197d3_0    conda-forge
numpy                     1.23.1           py39hda39a74_0    conda-forge
openblas                  0.3.20          openmp_h2608fb9_1    conda-forge
opencv                    4.5.5            py39h6e9494a_7    conda-forge
openh264                  2.1.1                hfd3ada9_0    conda-forge
openssl                   3.0.5                hb81d4ab_1    conda-forge
pcl                       1.11.1               h7984e4d_1    conda-forge
pcre                      8.45                 he49afe7_0    conda-forge
pip                       22.2.1             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pixman                    0.40.0               hbcb3906_0    conda-forge
proj                      9.0.1                h05f0992_1    conda-forge
protobuf                  3.19.4           py39h9fcab8e_0    conda-forge
pthread-stubs             0.4               hc929b4f_1001    conda-forge
pvl                       1.3.1              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
py-opencv                 4.5.5            py39h71a6800_7    conda-forge
python                    3.9.13          hf8d34f4_0_cpython    conda-forge
python-dateutil           2.8.2              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
python_abi                3.9                      2_cp39    conda-forge
pytz                      2022.1             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pyyaml                    6.0              py39h63b48b0_4    conda-forge
qhull                     2020.2               h940c156_2    conda-forge
qt                        5.12.9               h2a607e2_5    conda-forge
qwt                       6.2.0                h0f3c874_2    conda-forge
readline                  8.1.2                h3899abd_0    conda-forge
scipy                     1.9.0            py39h29d19b3_0    conda-forge
setuptools                63.3.0           py39h6e9494a_0    conda-forge
six                       1.16.0             pyh6c4a22f_0    conda-forge
spiceypy                  5.1.1              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
sqlite                    3.39.2               hd9f0692_0    conda-forge
suitesparse               5.10.1               h7aff33d_1    conda-forge
superlu                   5.2.2                h1f0f902_0    conda-forge
svt-av1                   0.9.1                h96cf925_0    conda-forge
tbb                       2021.5.0             hbb4e6a2_1    conda-forge
tk                        8.6.12               h5dbffcc_0    conda-forge
tnt                       126                           0    usgs-astrogeology
tzdata                    2022a                h191b570_0    conda-forge
wheel                     0.37.1             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
x264                      1!161.3030           h0d85af4_1    conda-forge
x265                      3.5                  hbb4e6a2_3    conda-forge
xerces-c                  3.2.3                h6564042_4    conda-forge
xorg-damageproto          1.2.1             h0d85af4_1002    conda-forge
xorg-fixesproto           5.0               h0d85af4_1002    conda-forge
xorg-glproto              1.4.17            h0d85af4_1002    conda-forge
xorg-inputproto           2.3.2             h35c211d_1002    conda-forge
xorg-kbproto              1.0.7             h35c211d_1002    conda-forge
xorg-libice               1.0.10               h0d85af4_0    conda-forge
xorg-libsm                1.2.3             h0d85af4_1000    conda-forge
xorg-libx11               1.7.2                h0d85af4_0    conda-forge
xorg-libxau               1.0.9                h35c211d_0    conda-forge
xorg-libxdamage           1.1.5                h0d85af4_1    conda-forge
xorg-libxdmcp             1.1.3                h35c211d_0    conda-forge
xorg-libxext              1.3.4                h0d85af4_1    conda-forge
xorg-libxfixes            5.0.3             h0d85af4_1004    conda-forge
xorg-libxi                1.7.10               h0d85af4_0    conda-forge
xorg-libxrandr            1.5.2                h0d85af4_1    conda-forge
xorg-libxrender           0.9.10            h0d85af4_1003    conda-forge
xorg-randrproto           1.5.0             h0d85af4_1001    conda-forge
xorg-renderproto          0.11.1            h0d85af4_1002    conda-forge
xorg-util-macros          1.19.3               h35c211d_0    conda-forge
xorg-xextproto            7.3.0             h35c211d_1002    conda-forge
xorg-xf86vidmodeproto     2.3.1             h0d85af4_1002    conda-forge
xorg-xproto               7.0.31            h35c211d_1007    conda-forge
xz                        5.2.5                haf1e3a3_1    conda-forge
yaml                      0.2.5                h0d85af4_2    conda-forge
zlib                      1.2.12               hfe4f2af_2    conda-forge
zstd                      1.5.2                ha9df2e0_2    conda-forge

I fixed the Library not found error by installing XQuartz. But now I have a new problem - I tried downloading some ISIS data by using the recommended command “downloadIsisData base $ISISDATA” but it says “downloadIsisData: command not found”. I looked in the ~/miniconda3/envs/isis/scripts directory and didn’t see the downloadIsisData script there. How can I get that script/program?

That is coming out in 7.1. For now, you can use the old instructions with 7.0.0: